按照主流科学解释，大脑的“本能的五感”包藏在大脑底部，控制着自律神经与波动共振等，和潜意识有关。但一般人大脑的五感，都受到理性的控制与压抑，因此很难发挥即有的潜在本能。在人清醒的时候，它便分别代行“第八识”、“第七识”的权能而起思维的作用。如果进入睡梦的时候，它就发起“意识”反面的潜在功能，不需“前五识”的现场工作，只凭借“前五识”原本收集的资料，就可生起“独立”的潜在作用。

因此，唯识学把“无垢识”的这种潜在功能，名为是阿赖耶识所藏的“无漏种子”，是人身真正的“自我”，可以脱离“前五识”而单独活动。它活动的最显著的范围，归纳起来有三种情况：即一作梦时。即二神经病、精神病，乃至因其他的病症而进入昏迷的情况时。即三禅定中某种境界时。所以从唯识学的立场来看，现代心理学所了解的“潜意识”，以及“第六感”等，仅是知道了“无垢识”的作用。知道活用大脑，可以具有听音辨色，或者浮现图像、闻到味道等“共感”现象。譬如将收到的信息以图像处理，瞬间即可完毕，在最强大脑什麽的舞台上一试身手。

古代修持者没有那么多花花肠子，他们只是凭着经验主义，通过苦行、“入静”等心理训练“排除显意识”，千百年修持不辍，终于铁树开花，得到了类似的突破。虽然那些修持境界听起来荒唐不经，但我却是半信半疑，不仅是因为我已经一只脚踏入了修持门槛。也因为这些佶屈聱牙的东西，居然和现代心理学严丝合缝的很。譬如潜意识，不是什么高大上的东西。却与人类社会息息相关。人类皮质脑的发育时间较迟，是造成许多负面和不良后果的程序，写入潜意识的其中一个理由。潜意识不仅是感觉的来源，更足以透过经验建立价值系统，而这样的经验，是对情绪模式造成影响的经验。当大脑的情绪部分，在早期发育阶段时，我们没有理性、成熟的显意识，去过滤负面程序，或是选择成人后所需要的正面程序。

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